菲律宾大学共有200个学生组织，既有学术机构、文化团体、社会服务社，也有联谊会（分兄弟会和姐妹会）、寄宿协会、体育团体。而学生会机构最大，发挥着重要作用。大学学生会由主席、副主席、12名会员以及各学院学生团体代表若干人组成，下设学院学生会分会。全校有30-40%的学生参加上述各类学生组织。

在各类学生团体的组织和领导下，学生课余生活丰富多彩。

《菲律宾大学》（周报）在迪利曼分校出版，完全由学生资助和编辑发行。该报创刊于1910年，当时取名《大学新闻》。

菲律宾大学作为菲律宾大学体育协会、全国女大学生体育协会成员，经常与其他大学组队参加东南亚体育运动会和世界奥林匹克运动会的各类比赛并取得名次，如篮球、女子体操、游泳、排球、射击、举重和田径项目。

菲律宾大学舞蹈队曾在国内国际舞蹈比赛中获奖，表演项目包括现代舞、菲律宾民族舞、爵士舞和古典舞。

大学合唱团自1962年成立以来，曾先后在亚洲、北美洲（美国和加拿大）和欧洲许多国家巡回演出并受到欢迎。演出节目有歌剧、小歌剧、民歌、古典歌曲、爵士乐歌曲、美国音乐会、音乐晚会等。

菲律宾青年乐团既是演出团体又是培训机构（招收7-24岁的青少年参加乐团强化培训，效果较好），该团曾在本国和部分亚洲国家巡回演出。

其他重要文娱团体还有大学吉他演出队、大学交响乐园、戏剧团、室内音乐乐队等。